我们再来看看毛文龙。毛文龙成名较早，而且他属于五军都督府，官至左军（毛文龙经营的辽东是为"左"，故为左军）都督府左都督，正一品。可见身为左都督的毛文龙官职要比兵部尚书袁崇焕大两个品阶，虽然袁崇焕后来被封"太子太保"但依然是从一品。如此看来袁崇焕诛杀毛文龙却是有越级诛杀自己长官之嫌，事实果真如此吗？
但从官职品阶上看，袁崇焕确实为正二品，而毛文龙为正一品，即使有尚方宝剑袁崇焕也不能据此诛杀毛文龙。但是我们要结合明末官职的实际情况来分析，明末五军都督府名存实亡，根本没有多少权力，规定其为"总内外诸军事"但实际上处处受制于兵部，只能执行命令，而且五军都督府本就一分为五，权力分散。
而且袁崇焕此次督军乃是身兼"左副都御史"这个职务去的，简单来说就是一个皇帝设立的临时监察机构，而袁崇焕就是"一把手"，他代表的是皇帝本人。并且袁崇焕带来的尚方宝剑乃是有圣谕"便宜行事"的"真尚方剑"，而毛文龙的尚方剑乃是和满桂、王之臣的尚方剑一样理应收回的"伪尚方剑"。试问身兼"左副都御史"、手持具有便宜行事功能的"尚方宝剑"的袁崇焕如何不能整治毛文龙。另外，如果袁崇焕无权斩杀毛文龙，或是没有崇祯授意，那为何朝中得知毛文龙被杀一事，崇祯并未治罪袁崇焕，甚至出言慰宽？欢迎讨论
