后来因在朝堂之上，以五品议郎之职，反驳一品司徒崔烈割地凉州，以求羌人之和，而得罪权臣与宦官。
后来爆发黄巾军起义，汉灵帝派出军方实力人物皇甫嵩带军讨伐，他久闻本郡名士傅燮的大名，于是选用傅燮为军司马。傅燮大破黄巾军，并俘虏了黄巾军首领卜巳、张伯、梁仲宁三人，位居首功。
但是在战争结束后，由于中常侍赵忠从中作梗，傅燮不仅没有功劳，还差点被问罪。并将他他调出了京城，迁到天下最乱的地方，汉阳郡为太守。
最后被犯乱的羌人引兵围城，而羌人官兵久闻傅燮的贤良，忠勇之名，几千人跪在城门外求他开门投诚，兵少粮缺的傅燮据不投降，引兵出战，最终战死沙场。如若汉朝汉灵帝，能听信重用傅燮等忠良之辈，那三国的历史必被改写。
