然而关于这场战争的结果却让人很是不解，历史资料上记载：蒙古军队阵亡十六人，明军阵亡五十二人。这个数据是不是很让人奇怪，10万大军打了一天，双方加起来才死了68人，而且潜意思指的是明军失败。但是蒙古经过此役过后，小王子伤重不治，蒙古族更是十年不敢进犯边境，种种迹象表明“应州之役”大大削弱了蒙古的军事力量，可不是区区死亡16人能够解释得通的。
但是最后的结果终究是好的，小王子被打退了 而大明的边境也重新获得了安宁，而朱厚照也完成了他在位期间的唯一一次远征，不久之后，朱厚照就在外出游玩的过程中落水身亡，而那次奇葩的战争则成了后世永远的一个谜团。
