张献忠部包围了凤阳城以后，在城内百姓的接应下，仅仅半天就攻破了城池，斩杀官军达2万人以上。凤阳守将朱国正战死，知府颜容暄被生擒。张献忠当着百姓的面，历数颜容暄的罪行后，处以死刑，并将胜利品和府库里的粮食分给当地的贫苦农民（早年的张献忠还是比较同情贫苦百姓的，否则也不会有那么多人跟着他造反），又叫农民和四乡百姓，砍光皇陵的几十万株松柏，还拆除了周围的建筑物和朱元璋出家的龙兴寺（又名皇觉寺），然后掘了皇帝的祖坟，同时将凤阳富户杀的一干二净。身在北京城的崇祯皇帝接到奏报，气得大哭不止，披麻戴孝到太庙向列祖列宗请罪，并严厉的追究丢城失地的责任。从凤阳逃回来的官员基本上都处死了（除了几位皇亲国戚没有被杀），甚至已经调任其他地方的前任凤阳巡抚、知府、总兵都被杀害。兵部尚书张凤翼先是被革职，一年后又在与后金（即满清前身）的交战中失败，畏罪自杀。尽管如此，朝廷也没有能够剿灭张献忠的起义队伍。相反，张献忠在老百姓的支持下，发展得有声有色。
1640年，张献忠为躲避左良玉的围剿，率部攻入四川，建立了大西政权。这里还有个故事，原本张献忠已经被左良玉逼到了绝境，眼看就要覆灭。张献忠派人重金贿赂左良玉说："朝廷重用你，主要是因为我的存在，如果我不在了，你的死期也就不远了！"左良玉是个城府比较深的人，一听此话有理，放了张献忠一条生路。但是他的一念之差，却给四川人民带来了灭顶之灾。
张献忠晚年，荒淫奢靡，残暴嗜杀。其统治四川短短六年时间，四川人口从数百万人下降到十余万。据说清军占领成都后，原本繁华的成都只剩下20户百姓，可见战乱和杀戮是多么的惨绝人寰（也有一说，清军入川后，恼恨川人支持张献忠，大肆屠杀川人后嫁祸给张献忠）。
