1598年，日本连番进攻朝鲜，当时明军在朝鲜抗击日寇的战争中多有失利，于是兵部推荐了邓子龙，立即得到了万历皇帝的允许。邓子龙联合当时的抗日名将李如松、陈麟以及朝鲜名将李舜臣给了日本侵略者以沉重的打击。
1598年9月18日，因为日本的一代枭雄丰臣秀吉病逝，加上日本在朝鲜受到明朝的沉重打击，因此经过再三权衡日本决定退兵回国。
不料日本的这一战略企图，被战略眼光毒辣的邓子龙看破了，于是年愈70邓子龙联合李舜臣决定在日本通过海上退回日本时候，最后在送日本一程。
不过最终因为邓子龙太过生猛，自己领着两百人就敢和日本数万大军单挑，最后自己孤身被围，当看到邓子龙被日军围困之后，朝鲜名将李舜臣立刻前去救援，最后两人没能突围出去，被日军杀死。不过，让国人愤怒的是，残忍的日本人竟然割掉了邓子龙的首级回国邀功去了，这就是历史上著名的"露梁海战役"。
邓子龙死后，万历皇帝命人用沉香木为邓子龙老将军刻了一个头颅，十分逼真。并曾邓子龙为都督佥事，朝鲜还专门修建庙宇专门祭拜邓子龙。
