在他考上进士，坐上太学学正时，北宋已经到了面临危亡的境地了，在靖康元年（1126年）金军带兵南下，打到汴京城下时，要求让宋廷割让河北三镇给他们。此时的宋廷已经不在团结，很明显的分为了两个分派，一个是由文官70多人同意割让土地，以求和平的主和派，一个是秦桧等36人坚决反对割让土地，应该与金国力争到底的主战派。
当时强大的金国很快就攻下了北宋的首都，导致北宋灭亡。史称"靖康之变"。从此秦桧的命运便开始悲惨了起来，经过三年的俘虏，他对金国的恐惧已经埋下了阴影，从一个力争到底、不愿服从的主战派，变成了不停向金国低头，换取生命的主和派。
最终靠着自己的方法回到了南宋，此时再回到南宋他，已经不在是一个标准的"爱国青年"了，他主张与金国议和，刚见到宋高宗，就对他提出"南自南，北自北"的说法。此时的宋高宗也早已被金国的实力吓破了胆，当秦桧提出提议时，正中他的下怀，毕竟他是皇帝，有损军心的话是不能说的，于是他觉得秦淮才是自己的该重用的人。
