众所周知，历来封建王朝的改朝换代都伴随着杀戮，新的统治者为了肃清敌对势力，大多将原有的势力消灭，以免留下祸患，但是大多的女子都都到了善待，毕竟在古代，女子没有什么威胁，因此，在朱棣称帝后，朱标的四个女儿们都得以保全性命。另外，朱标共有两位妃子，原配为太子妃常氏，于洪武四年嫁予朱标，并为他产下长子朱雄英、三儿子朱允熥。但是在生产朱允熥之时，难产而死。之后朱标娶吕氏为妃，并扶为正室，为朱标生下四子。朱棣在称帝后，自视理应为皇室继承人，不承认侄儿朱文炆的皇帝之位，废除原来的国号，并将朱文炆追封朱标的"孝康皇帝"的名号废黜，改为"懿文太子"，于是吕氏也自然降降为太子妃。之后一天，吕氏突然丧命于一场不明火灾中。
比起女儿来说，朱标的儿子的遭遇可要惨得多，朱标共有6个儿子，其中最大的和年幼的都早夭，并未能活到朱棣称帝。次子朱文炆前文提到，在朱棣发动靖难之役时，在宫中的突发大火中失踪，下落不明。而五子朱允熙，在朱棣称帝后与其母吕氏共住，也在吕氏寝宫的大火中丧命，由此可见，这场大火很可有能是朱棣为了除掉侄子，免除祸患而刻意为之。
