在修书过程当中，乾隆几回再三命令各级官员搜寻"禁书"，关于不积极的官员以至训斥定罪，官员饰们为了媚谄乾隆，不吝以莫须有的罪名将许多无辜之人牵涉出去，这也是乾隆期间"笔墨狱"众多的一个主要缘由，招致事先官方许多藏书被毁坏。
据统计在订正《四库全书》过程当中，清代廷一共烧毁了对大清倒霉的册本合计一万三千六百卷，燃烧各类禁书到达71万部之多，除去燃烧册本外，清代还对明代遗留的档案实行烧毁，估计有不下1000万的档案被烧毁，现在明代档案仅存三千余件，可以说清代焚书的数目跟《四库全书》收录的数目是一样多，即便那些没有被燃烧的册本，而被《四库全书》所收录的古籍，内容也是被篡改正的，这极大影响了文明的传承。不论是"焚书坑儒"仍是订正"四库全书"所激发的一些笔墨狱案，这些都是史书开展的必然趋势，许多工作不能以片面去判别，由于史书是不断在演变的，不论黑白，它毕竟仍是史书，你怎样看？
