可是接下来，段祺瑞派他去与孙中山对阵，结果冯玉祥前脚刚出门，就调转枪头指向了段祺瑞。这是段祺瑞根本没有想到的，冯玉祥指责他只知道与自己同胞相争，而不顾国家局势，一时间段祺瑞受到全国指责。接着段祺瑞只好在各路声讨中下台，这也是冯玉祥的第三次倒戈。
接着北洋军落入直系军阀之手，冯玉祥表示愿意追随。之后，他担任陕西督军，在陕西为自己扩大地盘。直奉大战时期，冯玉祥奉命接管河南，势力范围进一步扩大。不过此时，他与吴佩孚正在慢慢决裂。直到1923年，两人发展到水火不容的地步。但是直系终归还是吴佩孚掌权，冯玉祥只好转身投靠孙中山。直奉军阀打得不可开交的时候，冯玉祥得到了张学良50万大洋的贿赂，跑到北京发动了政变，导致直系军阀受到重创。
冯玉祥还顺便把溥仪赶出了故宫，接着邀请孙中山主持大局。之后张作霖入关，与段祺瑞和冯玉祥组建了一个临时政府。而吴佩孚则被打得差点被活捉。这就是冯玉祥的第四次倒戈。
