蒙古军队的最精锐力量即大汗的护卫军，称为''怯薛''，由一万名左右的军人所组成。护卫军的战士分为两种，一种是值日班的，大约一千人，还有一种是值夜班的，大约一千人，''成吉思汗这种十进制的军队形式，很机动灵活''。另有弓箭手，称为''豁儿赤''。不是所有人都有资格担任护卫军，只有贵族才能加入。护卫军战士地位很高，哪怕是一名普通的护卫军士兵，也要比其它军队的千夫长地位还高，而成吉思汗也经常是从这支护卫军中来选拨军队将领。蒙古军队分为三翼。左翼军在东边，开始是由札刺儿部的木华黎统领；中军则由八邻部的那雅统领，还包括成吉思汗的一千名护卫军士兵；右翼军由阿鲁刺惕部人博尔术统率。到成吉思汗1227年去世时，军队的实际人数达到了十三万人，其中左翼军六万二千人，右翼军三万八千人，其余的为中军和后备军。
成吉思汗在完成统一蒙古高原的大业后，他的蒙古军队己经是锋茫毕露，它们攻打西夏，出征金国，灭亡西辽，蒙古大军所到之处，可以说是所向披靡、无坚不摧。最主要就是依赖这三翼大军，同时基于这三翼大军成吉思汗确定了一项制度--黄金家族避难制度，所有的黄金家族成员都可以到亲戚处避难，所以当元朝被朱元璋消灭之后，黄金家族的成员都跑去了欧洲亲戚那边，因此现在欧洲大批人都是成吉思汗后裔，据说有1600万之多。
