宰相制最大的弊端就是专权，春秋三国之前，宰相就是一人之下万人之上，这种官僚制度在辅政的同时可以对皇帝各项事权形成制约，就导致皇权稍不注意，形容虚设，或者说傀儡。
随后，宰相制才变相废除，成就三公、三省、丞相制度、一省制度，再到朱元璋时期废除，变为内阁制度，自后，内阁大学士也变相于丞相，只是，权力大不如往昔。
宰相制的优势
宰相制的优势在于如果皇帝无能，那么行使宰相权力的最高行政官可以代皇帝决定一些大事情，不至于让朝代昏聩、国力有损。
例如曹操废三公，恢复丞相制度，就是一个弊端与优势的典型例子，弊端在于曹操专权，虽恢复的是丞相制度，然，行使的却是宰相权力。
