申时行的主要工作在于疏通上下级的关系，他的领导是皇帝，下面还有一大批大臣。有位不识趣的官员，上疏万历《酒色财气四箴》，大骂万历贪财好色，惹得万历皇帝大怒，本来是想重罚雒于仁的。
申时行则详细分析了此次事件的来因后果，多次奉劝万历大事化小，这才保住了雒于仁，也平息了万历的怒火。申时行虽然没有张居正的才干，却也是个股肱之臣，正是在他的疏导下，整个明帝国才能顺利周转。
万历十年的时候张居正已经去世，而申时行依旧可以为国发光发热，用人是个大学问，作为高层领导者，在用人这方面张居正做得很出色。
面对重重阻力，仍坚持改革
