针对南宋"江湖防御"体系，蒙古骑兵改变以往策略，攻击南宋薄弱部位，绕过沿江防御坚固的长江下游及江浙沿海地区，顺江而下，避实就虚，主攻长江上游地区，特别是江湖防御体系的至关重要点襄樊；蒙元针对南宋的水上优势，一方面组建水军，加强训练，特别是灭金之后，全盘接手了金国水军，在与南宋的不断交战中积累水军经验，壮大水军力量。
另一方面，蒙元通过招降南宋水军将领，不断瓦解南宋水军，特别是攻陷襄樊后，吕文焕投降，驻襄樊的战舰全部被蒙元获得，丁家洲一战蒙元又获得1000余艘南宋战舰，焦山一战后，蒙元与南宋水军力量发生逆转，此后在江海水域战绩上，蒙元不断取得胜利，这也注定了崖山海战的失败和南宋的灭亡。
在我国历史上，大规模水战和海战不少，但都没有南宋这样，整个王朝的兴亡与水战关系如此密切，南宋划江而治偏安一隅，没有了北方屏障和骑兵所需的良马，凭着完善的江海防御体系与金朝成功对峙百年，这也是南宋得以享国时间较长的原因之一。
