然而，这次"夺门之变"功臣之一的徐有贞，却与于谦矛盾极深。朱祁镇被俘之后，徐有贞曾建议南迁，结果于谦不仅坚决反对，并说，"提议南迁者都该斩首"。徐有贞此后虽然也在北京保卫战中立下功勋，奈何由于这次的南迁建议，不仅成为了朝堂的笑柄，而且就此升迁无望。后来，徐有功又通过于谦门生而求取升迁，于谦虽然向明代宗进行了推荐，奈何明代宗却因徐有功的南迁建议而没有同意，结果徐有贞认为是于谦从中作梗，就此对其极为怨恨。
眼看明英宗对于处死于谦还有疑虑，徐有功便说道，"不杀于谦，此举为无名"，朱祁镇听了此话，这才下定决心处死于谦。于谦对大明王朝的确有功，奈何正如徐有贞所言，如果不杀于谦，那么他们的复辟便师出无名。作为土木堡之变之后最为活跃的官员，于谦已经深深的打上了明代宗朱祁钰的印记，他有功于大明不假，但在这个特殊的时间段，他也只能成为皇权更替的牺牲品。
于谦不仅有功于大明，甚至有功于明英宗朱祁镇，是他在危急关头挽救了大明，更促使了朱祁钰将其接回，但权力的斗争从来都是血腥的，这不仅是于谦的悲哀，更是所有被卷入权力漩涡之人的无奈。
