不久，清朝命他与尚可喜一起进攻广东，他正要举师挺进，刑部却忽然上疏，告他的部将纵容士兵隐藏逃跑的罪人。论罪，耿仲明也要判死刑。其时多尔衮摄政，他假借顺治皇帝的名义，命令耿仲明械押逃跑人员回京。耿仲明在自己的部队中一下査出三百多名在逃罪人，他把他们上铐戴枷，押送京城，并上疏请罪。大臣们议论这事以后，认为即使不杀他也该夺他的爵位。然而，南方未平，多尔衮以皇帝的名义下诏宽释了他。
谁知他看到自己部下因此事杀的杀，判的判，感到自己下场也不会好，还没接到诏书就于顺治六年（公元1649年）十ー月上吊自杀了。耿仲明死后，他的儿子耿继茂统领他的部队。他几次请求承袭父亲的爵位，多尔衮都不允，直到顺治八年（公元1651年）顺治帝亲政，耿继茂才得到王位。耿继茂继承了王位，与尚可喜一同打下了广州。他们痛恨广州人民顽强抗清，竟下令杀尽广州城里青壮年男子。他们还在城中屯兵放马，把个山明水秀的广州，弄得乌烟瘴气。
不久，他俩又建起了两座隔街相望的壮观豪华的王府，老百姓见了那气派，隔开老远就绕道而行。耿继茂这个人十分贪婪，他私设税收，刮尽民脂民膏，弄得民怨鼎沸。广东布政使胡章，当时正从山东赴广东来上任。耳闻目睹了二人在广州的恶劣行径，上疏向皇帝揭发了他们的罪行。多尔却不辨是非，判了胡章诬告，论罪当绞，从宽发落，夺去官职。对二王呢，只是将耿继茂调往福建了事。
康熙十年（公元1671年）正月，耿继茂上疏说自己重病在身，申请让儿子耿精忠代理自己的职务，得到皇帝的批准。这年五月，耿继茂病重而死。就这样，耿精忠当上了靖南王。
