阿拉伯帝国占领波斯后，大力推行伊斯兰教，加之同时期穆斯林与蒙古势力的压迫，中亚摩尼教团被迫灭亡。于是乎，曾经传入中国且秘密发展的明教成了摩尼教仅存的"血脉"。到这里也就不难判断，《倚天屠龙记》中提到的波斯总教不远千里到中原寻找圣女是根本没有历史依据的。
最后，我们在再说一下朱元璋与明教的关系。
中原明教虽在元末一枝独秀，但是，这种好光景却也未延续多久。一方面，明教教义被其他诸如白莲教之类的秘密宗教吸纳发展，自身势力大减。另一方面，因明教长期活跃于地下，久而久之便在各地有了别称，诸如淮南的二桧子、江西的金刚禅等，均分走了明教的部分势力。
在元末风起云涌的农民起义中，当属朱元璋曾经加入的"红巾军"风头最盛。众所周知，朱元璋发迹于"红巾军"，而"红巾军"则是有明教背景的。有人分析，朱元璋早年曾加入过明教，所以，他才会将国号定为"明"。而明朝二百年的历史，也均始于明教。这种说法虽有些牵强，但是，也有一定的历史依据。
