对于慈禧的盛意，罗斯福和他的女儿都十分高兴，而且罗斯福也在准备着做出回报。1907年，罗斯福向国会提出议文：美国政府除确实费用及一切损失赔偿1165万元之外，所余1200万余元，实为浮数，受之有惭德，应以之退还中国，以全友谊……在他的努力下，这项提案在国会顺利通过。
1908年，美国正式宣布退还"庚子赔款"的一半，共计1160万美元左右给中国。这笔资金有着固定的用途，就是作为资助中国留美学生之用。1909年6月，经过中美双方协定后，在北京由清政府外务部建立了一所留美训练学校--游美学务处，这也是清华大学的雏形。同年8月，清政府将皇家林园清华园赐给学务处。胡适就是后来庚款留美学生中的一员。
慈禧看似简单的外交手段，却给中国带来了重大影响，即使在清朝灭亡后，这笔退款对培养人才也意义重大。
此后，受到美国的影响，英、俄、法也都退还了不同数目的赔款，用于教育事业。唯独日本对庚子赔款态度坚决，不仅要中国支付对日赔款，日本还打着退还庚款的旗号在华为自己谋取利益。
