这一番言论稳定了军心，而平叛也非常顺利，江南之地全部成为唐朝的地盘，李孝恭再次因功拜为扬州大都督，"江淮及岭南皆统摄之。"这样的影响力直追李世民，在一定程度上来说就是江南的老大。
等战事结束之后，李孝恭在扬州修建府邸，设立哨所护卫自己，俨然是要常驻此地。就在这个时候，远在长安的李渊坐不住了，虽然李孝恭是他的侄子，但是难保不会生出什么心思，如果真有了那样的心思，真的就是一个大的祸患。
就在这个时候，有人就上疏李渊说李孝恭有反心。李渊顺水推舟将李孝恭召回长安，然后命人彻查，李孝恭并没有想过要反，自然查不出什么实质性的东西。但是李渊既然已经将他召回了，怎么可能还放他回去，这样的人必须放在自己身边才能安心，于是就在长安给李孝恭安排了一个职位，即宗正卿。
宗正卿是一个从三品的官职，简单来说，就是负责管理李唐宗室和外戚各项事务的长官。这自然和带兵打仗完全不搭边，手中也没有了任何兵权。也是从这一刻开始，李孝恭再也没有上过战场。
