此后，李成梁对努尔哈赤多有包庇，只要他乖乖听话顺从，则立刻向朝廷保奏官职。对于其他各部落，李成梁则往死里打，搞双重标准。后来，李成梁干脆放弃宽甸六堡，此地乃遏制女真之前沿，战略地位非常重要，这就为努儿哈赤发展壮大创造有利条件。不过，李成梁也扶植舒尔哈齐（与兄长关系不好），让其牵制努儿哈赤，最好是能拉人出来自己创业。但是，李成梁被言官弹劾，提前下台回家养老。没了李成梁做靠山，舒尔哈齐自然斗不过兄长努尔哈赤，很快就被囚禁致死，其儿子阿敏、济尔哈朗后来也是被努尔哈赤儿子欺负，实在够倒霉的。
1615年，李成梁被罢官后6年，病逝于北京。3年后，努尔哈赤宣布起兵反抗明朝，而后攻击抚顺，终成大患。后来，大明王朝正是在关外女真与关内农民军夹击下灭亡。就此而言，李成梁应该承担相当责任，说他一手葬送大明王朝也不为过。若是知道有今日，李成梁会不会后悔呢？会不会后悔自己没有真正做到铲草除根呢？
