在军事上，他更是一次次打破清军对天京的围困，其战斗力简直可以用"爆表"二字形容。1852年，他率军西渡湘江，开辟河西基地，缓解了太平军的缺粮之危。之后，兵锋所指取得"水陆洲大捷"，带领太平军跳出了清军的包围圈，夺岳阳，占武汉，自武昌东下金陵，在短短的二十八天时间内，他率部纵横一千八百里，战必胜、攻必克，打得清军闻风丧胆。尤其是于1855年初在湖口、九江两次将湘军水师打得溃不成军，就连湘军统帅曾国藩也差点跳水自杀！
1856年3月，石达开在江西樟树再次大败湘军后，湘军首脑曾国藩为避其锋芒不得不龟缩到坚城南昌固守待援。正当石达开率军围歼曾国藩时，此时从天京传到一道命令，让他率军回天京参加解围战。石达开也不负众望，率军大破清军江南大营，解除了清军对天京长达三年的包围！
然而，随后太平天国爆发了"天京事变"，东王杨秀清被杀，韦昌辉和秦日纲先后被处死。见勤王有功的石达开深得人心，此时的天王心生疑忌，对石达开百般牵制，甚至意图加害。为了顾全大局，避免再次发生内耗，石达开不得已于1857年5月避祸离京，前往安庆，选择了＂另立门户＂！在其出走时，跟随他征战多年的部下大多数都同行，之后又陆陆续续收编了慕名而来的其他太平军士兵，加上后勤部队，总兵力共计30万。
