当时的宗室贵族以及功臣，虽然享有众多的特权，但与皇权统治发生冲突时往往会被统治者的意志所左右，法律在此时失去了过去原本的功效，勋爵们即使享有"丹书铁券"作为免死特权，但是他们的人身安全也得不到保障。
在明朝中后期，封爵制度也不再按照以前的标准，常常由皇帝的意志所决定，甚至还会受到权臣、宦官的影响，明朝正德年间，宦官刘瑾主持朝政，都督神英虽然没有开疆阔土的功劳，但是因为曾经贿赂过刘瑾与他关系交好，便被封为了武功伯。
明朝封爵制度中的特权与待遇与历朝历代相比都有所减少，最明显的就是不再有封地。
另外，在免死特权方面也有减少，特别是明朝后期，皇帝在颁发"丹书铁券"的同时，大幅减少了免死次数，并且虽然得以免罪，但是也少不了被处罚。
朱元璋时期曾实施"禁潘"，通过这种措施来惩罚犯罪的勋爵，他在故乡凤阳，设立了专门的特种监狱，在这里，犯人们所受的待遇和其他监狱几乎没有什么区别。
