因为这些原因，他在在官场上的名声还是很好。可能也正因为此，1589年初，她便被调入京城，在当时主要是担任大理寺评事。但是他来到京城之后，发现一个非常奇怪的现象，那就是他一年才见过皇帝3次。
其实在那个时候他已经算是幸运了，因为那是万历皇帝执政的时候，没有见过皇帝的大臣为数不少。当时他是七品官，但是他却非常胆大，做出了一些很多人都不敢做的是事情，比如说上书给皇帝。
大概内容说的是"你之所以会生病，那是因为酒色，并且还还非常贪财。如果你不守规矩的话，又要怎么要求大臣们守规矩呢？你自己都是这样不明事理的人，你的大臣们也不会有什么好人。假如我今天说的话能够让你听进去一些，即便你想处死我，即便我死了，也没有什么好遗憾的了。"他的这些话让万历非常的生气，毕竟什么花都在往他的心窝里插，因为他喜欢喝酒，还喜欢和妃嫔们在一起，他还有自己的小金库。
不过当时已经是岁末年初，他也不能对这件事处理，第二年的时候召集一帮大臣商量解决办法，其实就是想要严厉处罚雒于仁，但是很多大臣很维护他，皇帝也没有什么办法，过了几天，他便辞职了。他因为这件事出名了，后来在1621年，万历皇帝的孙子封他为光禄寺少卿。
