如果是日军被俘人员，美国人就会对他们进行彻底的消毒，一般让这些日本士兵把衣服脱下来，然后将其衣服和个人用品全部烧掉;再找一个很大的清水池，放一些消毒剂，要求这些日本士兵立刻洗澡。
除了极个别的情况，美国军队对日本人大都是比较好的，因为美国当时还是遵守日内瓦公约的。在给这些日本兵消毒完之后，美国军人还会给他们发放军装、衬衣、内衣、军鞋和洗漱用品，以防止病菌传染给美国士兵。
在大多数东南亚战场上，日本是没有制空权的;在中途岛战役之后，日本的制海权也没有了，所以日本人就只能在这些岛屿上挖地洞，甚至躲在山沟当中;而这些地方存在很多的传染病，不少人因此而感染了疾病。鉴于此，当时也只能对这些日本兵进行消毒，不过难以彻底阻断传染病的传播。
如果有大量的日本人感染了疾病，然后进入战俘营，会让为数众多的战俘染上疾病;有的时候这些疾病还会传染到美国的宿营地，从而给美国人带来巨大的灾难。所以美军被迫给这些日本人换衣服，用大量的消毒水对这些日本士兵进行消毒。
