朱由检继位后大力铲除阉党，勤于政事，生活节俭，曾六下罪己诏，是位年轻有为的皇帝。惜其性多疑，无法挽救衰微的大明皇朝。在位期间爆发农民起义，关外后金政权虎视眈眈，已处于内忧外患的境地。1644年，李自成军攻破北京时，于煤山自缢身亡，终年34岁，在位17年。朱由检死后庙号怀宗，后改毅宗、思宗。清朝上谥号守道敬俭宽文襄武体仁致孝庄烈愍皇帝，南明弘光帝上谥号绍天绎道刚明恪俭揆文奋武敦仁懋孝烈皇帝，葬于十三陵思陵。
世人都知道明朝是在崇祯皇帝的手上灭亡的，其实并不然，在朱棣靖难之后明朝就不算是完整的了，他迁都北平除了军事原因外，还有一个非常重要的原因就是南方并不是他的根基之地，也不是他的势力范围。南方是属于他的侄子朱允炆的，虽然朱允炆失去了首都南京，但那是他自愿让出来的，他还有南方广袤的天地。
明朝是在明教的基础上建立的，朱元璋继承了教主位置后，明朝就实行了政教合二为一的政策，明朝皇帝也是明教教主。皇帝既是政府的最高领导人，又是明教的教主。现在所谓的朱元璋屠杀明教徒都是后人篡改前人，后朝篡改前朝历史的结果。朱允炆放弃了皇位，但还保留明教教主的身份，实现了政教分离。
