李鸿章也不是说反对，他认为收复新疆必须要有雄厚的资金为后盾，有这些钱还不如放弃新疆，用来发展北洋海军，保护沿海地区百姓，维护近海海域，其实当时两个人的想法都没有错，错就错在清政府的腐败。
不过从今天来看，左宗棠收复新疆，时至今日新疆已经和中国融为一体，然近海海域中的岛屿几乎没有一个是没有争议的，所以后世文人时常称左宗棠为左公，而这一声"左公"可是他冒着生命危险换来的。
当时的清政府也意识到新疆的危害，倘若不收复，陕甘地区便会长期受到牵制，再者就连英、俄等国也虎视眈眈，渗透新疆，因此下令拨款200万两，其他各省再协助军饷300万两，左宗棠自己想办法筹借500万两。
看似军费十足，实则杯水车薪，左宗棠在兰州建立的"兰州制造局"为西征军修制造枪炮，造出大量武器，也是要大量开支，此时的左宗棠援引沈葆桢为台湾防务借款之旧例，请求借洋款1000万两，不过遭到沈葆桢反对。
