但，蒙哥的死震撼了整个蒙古帝国，并且对未来历史进程产生了深远的影响，蒙哥死后，忽必烈和阿里不哥开始争夺汗位，最终导致蒙古帝国开始分裂，1254年忽必烈夺得汗位后，原属蒙古帝国的术赤后王封地、察合台后王封地、窝阔台后王封地和忽必烈之弟旭烈兀的封地取得了事实上的独立地位，分别建立金帐汗国、察合台汗国、伊儿汗国、窝阔台汗国、铁木尔帝国。这些由蒙古人建立的政权被西方统称为"蒙古帝国"。
1271年，忽必烈在华夏建立大元帝国，全称为"大元大蒙古国"，其他四大汗国直到1304年才承认元朝的宗主地位，可见当年忽必烈夺权的时候造成的后果有多大，直到1368年，元朝才被明朝驱逐出汉地逃亡漠北，到17世纪的时候，蒙古帝国漠南蒙古被清朝统一。
