在这之前，清军早就听说了黄道周的名声，所以俘虏之后，先是对其劝降，后来无果，无奈下令将其斩首。行刑那天，在途径西华门的时候，因为这里曾经是专门为天子设立的御道，所以黄道周想要下车步行，谁知因为太久没有进食，身体一点力气也没有，刚走了两步就瘫软在地，随行的刽子手以为他是吓的，于是调侃道，没有见过这么贪生怕死的人。
黄道周听完，大声的驳斥：天下岂有畏死黄道周哉！刽子手听完，方知身边这个颓废的老人就是大名鼎鼎的黄道周，于是当即跪下，恭恭敬敬的请求他就在这里行刑。黄道周应允，但是有一个条件，那就是不会跪着受刑。因为其个子比较高，所以第一刀砍下去的时候，没有起到效果，于是刽子手又重新行了一次刑，这次黄道周才慷慨就义。百年之后，清朝的乾隆皇帝自诩为"十全老人"，很少把别人看在眼里，但是对于黄道周，却发自肺腑的崇敬，认为其无论是为官，还是在文字、诗歌、字画上的造诣，都堪称完美，倾心对其赞叹：不愧一代完人！
