慈禧于1908年11月15日去世。死后第二天，37岁的光绪皇帝去世的报道也出来了（死亡时间其实是14日）。
关于光绪皇帝的死因一直是扑朔迷离，很多人都认为正值壮年的光绪皇帝是被毒死的。但是由于技术的限制，这个说法一直无法得到证实。2008年，医学专家们对光绪皇帝的头发进行了分析研究，最后的结论是光绪皇帝死于砒霜中毒。至于毒杀光绪的人自然就是慈禧太后，这一点是基本可以确定的。那为什么慈禧一定要毒死光绪帝？
光绪死前一年，他曾亲自写下自己的病原："遗精之病将二十年，前数年每月必发十数次，近数年每月不过二三次，且有无梦不举即自遗泄之时，冬天较甚。近数年遗泄较少者，并非渐愈，乃系肾经亏损太甚，无力发泄之故。" 在御史胡思敬的记载中，有天阉一条，称"凡男子不能近女色者谓之'天阉'，……闻德宗亦系天阉，疑莫能明。或宫人因其无子而诬之，未可据为实录也。"光绪的确没有后代。
