京城里人心惶惶，没被杀的官员战战兢兢每天见面第一句话就是你们那里今天抓走几个，往往话还没说完，锦衣卫就到了，将问候之人抓走，之后就再也没回来。
在京城查完了，地方上也不能放松，因为郭桓是在京城待着，他不可能跑到外地自己去贪污，在地方上肯定也有同伙。深知圣意的吴庸觉得这是一次难得的表现机会，一定要深挖出郭桓的全部同伙，在朱元璋面前展现自己的精明能干。
锦衣卫深入各省和下面的州府县和农村，只要是和征收赋税等事关粮饷问题有关的人几乎一网打尽，就连交税的富户都没放过，因为这其中必定有贪污受贿逃税漏税。一时间各地风声鹤唳，无数人被抓。
事后经过统计因为郭桓一案前后被杀的将近三万人，中央地方官员几乎为之一空，无数中产家庭破产，全国呈现一种恐惧萧条的气氛。这样的处理远远超过了朱元璋一开始设想的范围，再杀下去恐怕就要失去控制激起民愤了，到时候必然威胁到大明统治基础。朱元璋不愧是帝王马上调转枪头，宣布郭桓案终结，处死郭桓等人，同时表示吴庸违背圣意，滥用职权，造成如此后果，因此决定杀了吴庸，以儆效尤。
郭桓案是朱元璋时期一起大案，这场案件使得整个明朝上层建筑全部置换了一次，大规模的杀戮使得幸存的官员没有一个不心惊胆寒当时人们就说："郡县之官虽居穷山绝塞之地，去京师万余里外，皆悚心震胆，如神明临其庭，不敢少肆。"
同时朱元璋为了以后避免官员们在账目上随意篡改金额欺上瞒下，他下令以后再涉及到账目书写数字的时候，不能再写之前的"一二三"等数字，全部改为"壹贰叁"等数字，这无疑增加了篡改贪污的难度，这项财会制度一直延续到今天仍然在使用。
