因为书中提到：在危地马拉的一个村庄，村里的土著人把水晶头骨拿给神父看，神父说是魔鬼制作的，于是就把那水晶头骨打得粉碎。书中说：其中有12个头骨的下颌骨能活动，称作“会唱歌的头骨”，里面存储了大量知识，是外星人带给地球人的礼物。为了协助知识的传播，外星人在地球上又制作了40个下颌骨不能活动的头骨，称作“会说话的头骨”。
在美洲印第安人中流传着一个古老传说：古时候有13个水晶头骨，能说话，会唱歌。这些水晶头骨里隐藏了有关人类起源和死亡的资料，能帮助人类解开宇宙生命之谜。根据传说，人们必须在2012年12月21日之前找到全部头骨。那天是循环了5126年的玛雅历法的终结日。除非13颗头骨聚集在一起并按正确的位置摆放，否则地球将飞离轴心，而只有那样做，头骨的超自然力量才能挽救地球。当然，这传说到现在已经没有意义了。
科学家们曾把水晶头骨和真正的人类头骨作了比较，发现除了眼部特征稍稍偏于人类的正常范围以外，其他参数都与真正的人类头骨相差无几。我们知道，近代光学产生于17世纪，而人类准确地认识自己的骨骼结构更是18世纪解剖学兴起以后的事。这个水晶头颅却是在非常了解人体骨骼构造和光学原理的基础上雕刻成的，一千多年前的玛雅人是怎样掌握这些高深的解剖学和光学知识呢？
据说水晶头骨有催眠功能，如果让人的眼睛紧紧盯着水晶头骨的眼睛处，不多时就会感到昏昏欲睡，传说头骨是玛雅人为病人做手术时催眠病人用的。另外，有谣言说：水晶是世界上硬度最高的材料之一，用铜、铁或石制工具都无法加工它，而一千多年前的玛雅人又是使用的什么工具呢？