武帝走后,司马道子对赵牙说:"皇上要是知道这灵秀山是人工堆起来的,你的脑袋只怕就要搬家了。"赵牙毫不在意,胸有成竹地回答:"只要有你丞相在,我赵牙就死不了。"司马道子崇信佛教,僧尼成为相府的座上客。有一个尼姑叫支妙音,备受他的青眯。司马道子专为她盖了一座简静寺。因支妙音手能通天,简静寺前面车水马龙,趋炎附势的人来往频繁,支妙音甚至还企图干预朝政。司马道子的儿子司马元显平定了王恭对朝廷的讨伐,及后政事皆由司马元显掌握,司马道子则终日蓬首昏,沉测于酒醉之中。
司马元显最终败于桓玄的征伐,权倾朝廷的司马元显连同他的六个儿子全被杀掉,其父司马道子被废为庶人,在流放地安成郡(今江西安福)饮鸩酒而亡,时年39岁。