这其中最有名的，就是明初四大案之一的郭桓案。洪武十八年（1385年）户部侍郎郭桓等人伙同各省官吏盗卖官粮，后被人揭发，因所涉金额巨大，朱元璋将六部左右侍郎以下皆处死。为了追赃又牵连到全国各地的地主，遭到抄家破产的不计其数，地主对此怨恨极深，朱元璋为了平息怨气又将审刑官吴庸等人处死。
朱元璋处置贪腐，可以用"决心之大、力度之强、措施之精确"来形容，当政31年，先后发起6次大规模肃贪，杀掉贪官污吏15万人，这样的雷霆手段确实是历朝历代其他帝王所没有的，同时也起到了强烈震慑作用。但是直至朱元璋去世，贪官现象始终未根除，而朱元璋也只能在晚年发出"朝治而暮犯，暮治而晨亦如之；尸未移而人为继踵，治愈重而犯愈多"哀叹。
朱元璋虽然用尽严刑峻法惩治贪腐，但却忽略了三个问题，致使贪官屡禁不止。
首先，朱元璋过高的估量的为官者人性。
朱元璋认为，为官者就应该是施政为民，尊崇传统的儒家经典教化，"静以修身、俭以养德"，而没有看到读书人、为官之人也有着贪念，单纯的把清廉当成了职责，而没有考虑到官员为官的真实需求。
