1581年，莽应龙去世，其子莽应里继承王位，明朝和缅甸的战争还在持续。但是莽应里在军事才能上不及莽应龙，因此对外战争基本失败。从1583年到1598年，莽应里不断进攻云南，但是都遭到了失败，而孟养、木邦、陇川、孟密等土司又重新回到了明朝怀抱。1593年，缅甸内乱，而莽应里在对阿拉干的战争中被俘虏。
缅甸的土司分布
此后，莽应里之弟良渊侯继位，又开始进攻云南孟密、蛮莫，蛮莫土司思正逃到黄连关，向明朝求救。然而云南的长官却将思正死了，以求缅军停止进攻。1604年，孟养被缅甸所灭。1606年，缅甸进攻木邦，明朝军队不敢救援，木邦失陷。至此，明朝和缅甸的战争宣告结束，明朝的云南外夷土司基本被良渊侯攻陷。1605年，良渊侯去世，其子阿那毕隆继位开始挥戈南下，投入到统一缅甸的战争之中。
