朱元璋也是个直性子人，告诉吕昶自己不可能跟着元朝廷混，又强行把他留在身边。明朝建立后，吕昶派到户部任职，做着老本行，把大明财政打理得井井有条。后来，朱元璋决定废除中书省，不再安排宰相之职，满朝文武都了解朱元璋的脾气，没有一人敢反对。
然而，吕昶却不顾危险，一次上朝的时候冒死直谏，还写了很长的奏折，请明太祖朱元璋三思而后行。朱元璋愤怒不已，就怒吼道："大胆吕昶，如果你再敢如此，朕就用箭射死你。"吕昶不为所动，结果朱元璋真的拉起弓箭，太子朱标都拦不住，只不过朱元璋爱惜吕昶的才华，只把他射伤，起到杀鸡儆猴的作用。
