在某些方面，东林党的主张对朝廷非常不利。例如，江南的工商税收十分低。税收低了，国库的收入就少了。没有钱，寸步难行。朱由校明白这点后，通过阉党拿回了税收的话语权。当时，仅从浙江收取的茶税就高达20万两，是之前的数倍，说明他的措施有成效，让国库充盈起来。
登基不久，明朝就丢失了辽阳等军事要地。于是，朱由校立即提拔袁崇焕、袁可立等人驻守边疆。后金迫于这些人的威严，不敢轻易来犯。不久，辽东的局势稳定下来。可惜的是，他们后来也卷入了党派之争，沦为了政治的牺牲品。在澳门问题上，朱由校态度强硬，派兵与荷兰殖民者两次在澎湖交战，明军还取得了胜利。
由于客氏嫉妒后宫的妃子，只要有谁怀孕了，都会被她想方设法除掉，因此朱由校一生没有孩子。临终前，他把皇位传给了弟弟朱由检，还嘱托弟弟要好好对待自己的结发妻子张皇后。为了不让她受到迫害，朱由校力保妻子。可见，他不是一个冷血无情之人。
朱由检即位后，大力打击阉党，魏忠贤被处死，两派相互牵制的平衡局面被打破，朝廷内部出现了问题。同时，后金趁火打劫。没过几年，明朝就灭亡了。
