这样的制度运行了一段时间后，问题又逐渐地暴露出来了。被选入的辅官年龄比较大不说，还没有什么处理政务的经验，往往是按照儒家经典里的记载行事，在很多事情上都会脱离实际。同时十天一轮值的制度倒是限制了他们的权力，但是对于处理政务的连续性和效率而言，有百害而无一利。辅官们感觉难以胜任本职工作，相继请辞或退休，朱元璋也感觉并没有达到他所期望的效果，于是此制度仅运行了一年多就停止了。
明朝的中央集权
后来，朱元璋又仿照宋朝的制度，设立殿阁大学士制度。以礼部尚书刘仲质为华盖殿大学士，翰林学士宋讷为文渊阁大学士，检讨吴伯宗为武英殿大学士，典籍吴沉为东阁大学士。大学士为皇帝的侍从文臣，为皇帝决策事务提供咨询，但是在整个朱元璋当政期间，诸位大学士们很少能参与决策，只是发挥着顾问的作用罢了。
