见不能正面取胜，皇太极决定实行反间计，他散布谣言，说袁崇焕与自己私下勾结。北京城本就数十年没有战事，城里的勋贵们见到女真人竟然能突破关隘，打到这里，自然对身为蓟辽督师的袁崇焕十分不满，他们向朝廷告状："袁崇焕名为入援，却听任后金军劫掠焚烧民舍，不敢前去阻拦。"
崇祯皇帝本就多疑，当他听到谣言，看到大臣们的奏章以后，就对袁崇焕起了疑心。袁崇焕作战期间，请求入城休整，遭到崇祯的拒绝。不仅崇祯对袁崇焕不满，连守城的将士也觉得袁崇焕是汉奸，他们大骂袁崇焕，还在城墙上扔石头，将三位宁远士兵砸死。有的人还将巡逻的宁远士兵抓走，向他们勒索钱财，不给就将他们杀死。
自己在城下浴血奋战，背后却被自己人插刀，宁远军中不满的声音越来越大。然而这些声音传到崇祯皇帝的耳朵里，却让他更加不满。
1629年十二月一日，崇祯帝逮捕袁崇焕，一旁的祖大寿战战兢兢。回到军中以后，祖大寿愤懑不已，他率领一万多人脱离战场，要求崇祯释放袁崇焕。崇祯没有办法，让袁崇焕写了一封信，送到祖大寿军中，让他们继续作战。祖大寿激励士兵拼死作战，立功给袁崇焕赎罪，但是崇祯帝最终还是将袁崇焕凌迟处死。
