等到时机慢慢成熟，李治再次争得了李世勣的支持，随即直接下令将王皇后、萧淑妃废为平民，关入别院，立武则天为皇后。随后将长孙无忌、褚遂良、于志宁等人被贬官流放。
李治借助废立皇后这件事，重新掌握了朝廷大权，在这其中武则天功不可没。武则天更是双丰收，不仅得到梦寐以求的皇后宝座，李治对其基本上也是言听计从。
在这段时间，经过长时间的观察，李治发现了武则天的与众不同，她不仅才华横溢，而且深通权谋，是个标准的政客，在孤立无援的皇宫大内，武则天将是他最好的帮手。
有些人说李治稍有昏庸，武则天让他干什么，他干什么，事实上并非如此，李治的每一步都有着深刻的政治目的。
公元660年，李治的风疾就开始发作，对于一个满腔抱负的年轻皇帝，这是多么令人痛惜的事。迫不得已，李治就得分担部分政务交于武则天处理，这是理性，也是无奈之举。
