咸宁公主与宋瑛的感情也一直琴瑟和鸣，恩爱欢愉。但是天妒英才，正统年间，为抵挡倭寇侵华，宋瑛战死沙场，咸宁公主伤痛欲绝，不久后也长辞人世。
史料记载咸宁公主去世之前曾立遗嘱 “不幸之后，务归葬于原籍溧水县，俾后之子孙便于祭扫”，故于正统六年，后人将其葬于南京溧水。
几百上千年过去了，他们的墓室隐藏在隐蔽的山崖中，无人发现。第一次被发现时，却因不得而知的原因重新封闭，许多人认为里面隐藏着什么惊天秘密，或者有富可敌国的金银财宝。
后来根据当时考古队队长的解释才知道，原来墓室第一次被打开时，不知是何原因，墓中积水严重，咸宁公主和驸马的棺材盖都漂浮在2米多高的水面上，经过抢救性考古发掘后，由于当时的技术受限，此墓被迫再次封闭，但是因其独特而极具价值的墓室建筑风格，此墓得以妥善保存。
后来为不破坏墓室主体选择从上方开挖，但是因为流水过多和陆续发现其他墓室，不得不扩大开挖面积。几乎一半山体被挖，而咸宁公主墓最终得以完整开挖和保护。
