日本人的来源方面，传统上认为来自中国的见解曾经一度成为主流。不过，最新的研究认为，最早的日本人来自东南亚的可能性很高。
《日本经济新闻》12月3日报道，日本的绳文时代（约为公元前14,000年至公元前400年）就居住在日本列岛的人们究竟是从哪里来的呢？最近的研究对在绳文遗迹中发现的人骨进行调查后发现，其DNA与东南亚的古代人种接近。
虽然迄今为止有各种各样的假说，但都缺乏科学论证的证据。以遗传信息为基础、解开古代人迁徙路线的研究有望拉开帷幕。
位于爱知县渥美半岛的伊川津贝塚是日本具有代表性的绳文遗迹。2010年在这里出土的大约2500年前的成人女性骸骨成为了这个研究的重要依据。
以日本金泽大学、北里大学和国立历史民俗博物馆为中心的团队小心采集了头骨中仅存的一点遗传基因，并成功解读了全部遗传信息。2018年7月，金泽大学特任助教觉张隆史以遗传信息为基础，发表了关于绳文人起源的研究成果，表示“这是解读绳文人全部遗传信息的首次成果。与东南亚人的遗传信息相比较，找到了研究遗传方面关联的线索”。