也正是因为这样的名气，208年时，曹操请来华佗为他治疗自己多年的偏头痛。可“圣手”却只是说道，这个病需要开颅手术才能得以根治。那个时候麻沸散已经被发明了，民间也有很多手术的例子，但是作为一个生性多疑的曹孟德，他如何会让人对自己的脑袋动刀？更何况，在那个医疗水平不成熟甚至连无菌环境都没有的时候，这种手术致死率太大了。
毋庸置疑，曹操听到这样的消息雷霆震怒，他立刻怀疑这是蜀汉或者孙吴派来暗杀他的奸细。恰巧这时华佗妻子寄来家书，他直接告罪回乡不再前来。这种结局自然只会招来曹孟德更大的猜忌，最终，一代名医被抓捕入狱，拷打之后含恨而死。他的《青囊经》也在这时期遗失，再也没有出现。
