我们知道，袁崇焕最后被朝廷凌迟处死，在朝廷对袁崇焕的指控里，有一条“以谋款则斩帅”的罪状，“谋款”就是私下密谋与后金议和，“斩帅”就是诛杀了毛文龙，也就是说他为了私下与后金议和而谋杀了毛文龙。
但是事实上，毛文龙却有与皇太极议和的举措，但是并没有成功，再加上此人为人骄恣，所上事多浮夸，索饷过多，袁崇焕才杀了他。
这一杀不要紧，却连累了大明王朝，毛文龙部下孔有德、尚可喜、耿仲明投靠大清，分别被封为定南王、平南王、靖南王，这三人在大清灭明中扮演着不可或缺的角色。
而皇太极得知毛文龙死后，绕开宁远、锦州，越过长城，直逼京城，把京城周边抢掠一空，袁崇焕苦心经营的“宁锦防线”彻底的变成了一条名副其实的“马其诺防线”，大明王朝名存实亡，李自成趁势崛起，崇祯皇帝自缢。
