1688年5月30日，清朝派出由领侍卫大臣索额图、都统佟国纲、尚书阿喇尼、左都御史马齐、护军统领马喇以及汉官张鹏翮、陈世安等人组成的代表团前去谈判。康熙最初给的底线是：一、尼布楚、雅克萨、黑龙江上下，及通此江的一江一河，皆为中国之地，不能拱手送给俄国人。二、俄国必须遣返将叛逃的达斡尔族首领根特布尔。不过后来由于准噶尔叛乱，康熙又降低了自己的底线。“今以尼布潮（也就是尼布楚）为界，则鄂罗斯遣使贸易无栖托之所，势难相通。尔等初议时，仍当以尼布潮为界。彼使者若恳求尼布潮，可即以额尔古纳为界。”
我们看一下康熙给的底线，说白了最初的时候尼布楚、雅克萨、黑龙江上下都是清朝的，不能让给别人，毕竟这是清朝的领土。后来底线又降低了，直接变成额尔古纳河为界。就是说，康熙已经做好割让大量领土给俄国了。最终签订的《尼布楚条约》比康熙的底线还过分“格尔必齐河、额尔古纳河及外兴安岭为中俄东段边界，乌第河地区为待议地区”。就是说，索尔图退步了非常多。本来尼布楚以南的土地都是清朝的，现在连额尔古纳河都没能全部保住。但康熙对这个条约的态度超出所有人意料。
