文物专家赶到之后，在工人们的帮助下对该文物遗址进行了深度发掘。在发掘过程中，专家们先是发现了不少印着青花的瓷盘与瓷碗，接着又在淤泥中找到了一具长5米、宽2米的船形遗骸，由此断定这是一处古代沉船遗址。
专家们经过发掘，又陆续找到了深埋于淤泥中的煤炭、铁锅、烟囱残片，以及少量的铜钱。通过对铜钱年代与成色的观察研究，专家们也为沉船的信息进行了定位，它应该是一艘乾隆时期的古船，而之前出土的木雕圆木，应该就是沉船的桅杆。
专家们在挖掘过后，却失望地发现，如此一艘很具规模的遗骸附近，居然没有出土多少有价值的文物，大部分文物都是一些船上人员生活中的常见用品。可以毫不夸张地说，甚至出土的少量铜钱，已经算是"珍贵"的文物了。
此时一个疑问也在专家们的心头产生了，这艘古代沉船究竟是如何沉没的呢？如今的线索只有两个，第一是船上折断的桅杆，第二则是船上没有值钱的东西。按照正常情况推断，桅杆的折断，很可能是因为小船在河面上遇到了强风。船上没有值钱的东西，也许是船员们在行船的过程中，遭受了海盗的洗劫。
