到了现代，在日本更是为徐福建庙修祠，徐福也因此被日本千秋万载的参拜。公元前213年到公元前212年，等到徐福再次回到秦国时，便正好遇到了秦始皇进行焚书坑儒，看不惯秦始皇的暴政且为了自保，便跟秦始皇说，有仙丹，但是因为海中有鲛鲨，不好通过，希望秦始皇能除去鲨鱼方能够拿到仙丹。
数年没有回来的徐福说出的话竟然让秦始皇信了，于是派兵把所谓的鲛给歼灭了，其实就是几头无辜的鲸鱼，杀了鲸鱼之后，徐福又再次踏上东渡的征程，不过这一次去，便再也没有回来。也给后人们留下了一个神秘的包裹，但其实仔细想想也就能想明白了。
徐福给当时的日本带来各种技术，如种植谷种、以及如何制造和使用农具、药物及生产技术和医术，有了这些技术后的日本，社会生产力突飞猛进，当时的日本人很崇拜徐福。传言，徐福除了带着这些技术还有带着当时的汉字，并广为传播，现在的日本文字就是由汉字演变而来的，这种说法的真实性还有待考究。
