在这些问题之外，其实还有两大秘闻，流传千年至今，一直吸引着国人进行探究。
一是为什么秦始皇陵长达两千多年没有被发现呢？这不合情理啊，那么大规模的墓葬怎么可能藏那么久，而且按说盗墓贼专会寻找前朝达官贵人的坟墓寻宝，史书上又记载过秦始皇陵规模之大旷古烁今，盗墓者随便挖一点宝物出来就够挥霍一辈子的了，没有理由发现不了秦陵才对。其实在秦陵建造之初，嬴政就考虑过墓葬被发现甚至被盗的可能。据史料记载，秦始皇命人将皇陵挖深至地下泉水涌出之处，再以滚烫铜水浇筑，冷却以后就形成了天然的铜墙铁壁，除非地震否则依靠人力是难能挖掘开来的。
还有据史料记载，秦始皇陵中有一条用水银浇筑而成的运河，现代的科学探测也证明了秦陵附近确实汞超标，这是一种剧毒物质，别说盗墓者了，即使是用现在的高科技技术，在没有探明地下情况的时候，也不敢冒然挖掘。除了以上这些原因，更不用说皇陵内部埋设的种种机关和以假乱真的伪墓了，这些都大大增加了秦陵真身被发现和挖掘的难度。
