1673年(康熙十七年)，年已74岁的吴三桂在衡州称帝，国号大周，但未能改变叛军的困境。同年秋，吴三桂病死，形势陡变。叛军无首，众心瓦解。其孙吴世璠继承帝位。清军趁机发动进攻，从此叛军一蹶不振，湖南、广西、贵州、四川等地逐步为清军攻陷。但马宝、胡国柱等叛军仍困兽犹斗，节节顽抗;满洲将帅仍多迁延，以致时逾两年，清军才进逼云南，康熙二十年底，围攻省城昆明。吴世璠势穷自杀，余众出降，清朝的三藩之乱至此告终。
平叛战争结束后，清廷没收藩产入官充当军饷，撤藩回京师。除吴三桂部调往边区站、台服役外，其余各部重新编入八旗。福州、广州、荆州派八旗兵驻防，广西、云南派绿营兵镇守，彻底消除了藩镇制。其后，中国历史上出现了一个让今日的人们多少有些不解，甚至感到新奇的群体——站人。据清史记载，清兵入关，吴三桂投降有功，被封为平西王，带领部将镇守云南。在云南，他招兵买马，又吸收了不少当地少数民族(苗族人)入伍。叛乱被平息后，吴三桂旧部连同家属分别接受了处罚，有一部分人员被发配到了辽宁、吉林。
1685年雅克萨战役之后，清廷出于对驻防及军事供给等方面的考虑，在黑龙江境内设立了从瑷珲到吉林的驿站，驿站路线及选派驻驿人员几经变更，最终确定设立25个驿站。让谁去驻守呢?清廷想到了奉谕旨进京甄别的“吴藩”投诚官兵。这些人也受到了牵连，被抄没家产，一些男丁在京城无事可做。清廷对他们进行进一步甄别，与从发配至辽宁、吉林的吴三桂部分旧部中挑选的男丁一起调拨充当站丁。这一群体成了后来站人中的主流群体。