辛亥革命成功后，宫崎滔天随孙中山到达南京，参加了老友就任临时大总统的典礼。那天，宫崎滔天伏地大哭，有人问他为何哭泣，他答曰：“恨我生不是中国人！”
二次革命失败后，宫崎滔天又全力庇护逃亡的革命党人。1917年，宫崎滔天专程从日本赶到长沙岳麓山参加黄兴的葬礼。当时，正就读于湖南省立第一师范学校的毛泽东、萧三（萧植蕃）等，因为仰慕其人格，曾写信邀请他来学校演讲：
久钦高谊，觌面无缘，远道闻风，令人兴起。先生之于黄公，生以精神助之，死以涕泪吊之，今将葬矣，波涛万里，又复临穴送棺。高谊贯于日月，精诚动乎鬼神，此天下所希闻，古今所未有也。植蕃、泽东，湘之学生，尝读诗书，颇立志气，今者愿一望见丰采，聆取宏教。惟先生实赐容接，幸甚幸甚。
湖南省立第一师范学生 萧植蕃、毛泽东 上
据说，宫崎滔天接受了这一邀请，到第一师范做了演讲，主题是他一贯的主张：黄色人种的团结。
1921年，孙中山在广州再次组织起革命政府，为了帮助老朋友，宫崎滔天从初夏呆到深秋，才返回日本。1922年12月6日，宫崎滔天因为肺结核，病逝于东京，终年51岁。死讯传来，孙中山痛呼“中国人民失一良友”！
