研究表明日本人和藏族在基因上是近亲，东亚其他地区除了西藏其他地区都没有d基因。日本的基因是西藏基因占50%成分，至于西藏人怎么到了日本这就不得而知了。
还有一部分来自南亚即c基因是3万年前位于菲律宾群岛和印尼群岛的南亚人迁徙过去的，还有一部分是极北基因2万年前位于西伯利亚与北海道地区的人迁移来的，基本是个混合人种。
从这里可以断定，徐福不是日本人的祖先。
但是根据日本人的考证，徐福确实到过日本。
分析古代墓葬遗骨证明，徐福东渡时期，日本关西地区的居民平均身高骤然升高了5厘米，由此推断，这很可能是徐福和他的部属登陆后造成的局部人种改良。
还有一个有趣的现象，就是日本科学家发现日本人的基因里，有1％来自中国云南地区，而日语训读发音(土语发音)也和云南纳西族的语音有很多相似之处。
这是怎么回事呢?
从徐福东渡，或许可以找到答案。根据中国方面的史籍记载，徐福要求的三千童男童女，秦始皇也没法一下子凑齐，这个时候，秦军刚巧征服了西南夷，于是秦始皇就下令这些被征服的部族提供所需要的童男童女。
西南夷，就是现代云南各民族的共同祖先。因此，如果这些西南夷的后代借徐福东渡融入日本人种，带给日本人1％的云南基因便有据可循了。
所以说，徐福不是日本人的祖先，却帮助日本改良了人种。
