03研究了95%的尖吻浣熊属动物标本,才确认了小尖吻浣熊,还发现了4个亚种,科学家在厄瓜多尔Otonga保护区发现了一些同标本类似的生物活动的痕迹,不过它们看上去有点像是浣熊家族的另一物种——蜜熊留下的。后来,他们同当地猎人进行合作,终于成功猎捕到一只小尖吻浣熊。之后的几年里,研究者们辗转于厄瓜多尔和哥伦比亚的山地雨林,研究小尖吻浣熊的行为习性。研究了世界上95%的尖吻浣熊属动物标本。这样,他们不仅确认了小尖吻浣熊同其他尖吻浣熊属物种之间的进化关系,还发现了小尖吻浣熊的四个亚种。
不过,小尖吻浣熊与尖吻浣熊仍可被视为姐妹种群,大约在三四百万年前,小尖吻浣熊才脱离尖吻浣熊单独进化,形成了一个物种。在安第斯山脉北部地区,小尖吻浣熊进化出四个亚种,分别生活于不同地区,它们的个体大小和毛发颜色也均不相同,这与它们生活的海拔高度有很大的相关性。